一般市面上的玉米是經過人工育種，例如：
玉米爸爸基因型AABBccddEE ...... 玉米媽媽基因型aabbCCDDee.....
(爸爸提供一半基因)→花粉ABcdE... X (媽媽提供一半基因)→玉米粒內的卵abCDe...
↓
第一代 小孩 AaBbCcDdEe...
英文代表每個基因，基因是一對一對的，在一對中有大寫的英文代表顯性，兩個都小寫的是隱性，以人類來說耳垂是分離還是緊貼就是種顯隱性的關係。對玉米來說基本上性狀顯性的越多生長力越好，所以種苗公司會種玉米的爸爸媽媽兩個品種，然後把媽媽品種的雄穗剪掉，讓爸爸品種的雄穗去對媽媽品種的花絲做授粉，生出來的每一個玉米粒的基因型會是相同的。
如果自己買了商業品種回來，想自行留種，基因型會變成像下面一樣
商業品種(第一代小孩) AaBbCcDdEe.....
花粉aBcDe... X 卵aBcde.... (花粉和卵大小寫英文隨機產生)
↓
第二代小孩 aaBBccDdee....
第二代小孩的顯性基因自然會變得比較少而且每個花粉和卵的基因都會不一樣，所以玉米上玉米粒每一顆都是不一樣的性狀，所以自行留種後的小孩會參差不齊，如果再留到第三代基因型會更亂。
所以如果想擁有自己的品種，栽種上必須分為栽種區和育種區，兩區的花粉不能互相影響，然後重複人工自交的玉米通常基因會同型化AA或是aa，所以就可以建立爸爸的品種和媽媽的品種，然後自行交配，就能有自己的品種。中間過程絕對不能讓花粉亂飛，不然會失敗。以前學校學的淺見，有錯請指教。
PS：以上所舉的例子為單交育種，玉米的育種還有雙交、三交.....等。
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